祈愿系统是获取强力忍者的重要途径，但如何选择适合自己的忍者需要综合考虑强度、上手难度以及个人操作习惯。技术型玩家可能更关注忍者强度上限，而普通玩家则需优先考虑操作门槛。例如秽土鼬虽然强度高，但二技能防反机制需要精准操作，对新手并不友好。相比之下，面具男等伤害稳定且操作简单的忍者更适合中低段位玩家。参考高玩榜单时需结合自身技术水平，避免盲目追求高强度但难以驾驭的忍者。
祈愿系统分为普通祈愿和高级祈愿两种类型，资源消耗与奖励品质直接相关。普通祈愿每日有10次免费机会，高级祈愿则有半价优惠，玩家需合理分配金币和钻石。紫色以上品质的忍者卡牌能解锁特殊技能和觉醒形态，大幅提升战力。幸运抽奖和连续抽奖机制可提高效率，但需注意运气值对结果的影响。通过参与游戏内活动、任务积累运气值，能间接提升高品质卡牌的获取概率。服务器时间和玩家等级也会影响祈愿结果，建议在资源充足时集中抽取。
春日祈愿等限定活动中，B忍选择需平衡强度与收藏价值。奥摩伊、鹰水月等属于第一梯队强度，适合追求实战表现的玩家；畜生道紫阳花、新春井野则更具收藏意义。若已拥有热门忍者，可优先选择忍刀七人众成员或带尾兽的老紫等特殊角色，以备后续任务需求。需注意忍者返场周期，部分限定忍者如新春系列返场机会较少，选择稀有度更高的角色更具长期价值。
祈愿夺宝等活动规则常随版本调整，需关注保底机制与资源消耗。早期金运祈愿屋需充值金币参与，现改为铜币直购且保底价格降低，但更新周期不固定。类似金章招募的规则，祈愿商店重置时间未明确标注，玩家需预留资源应对突发更新。忍战凯等角色保底需328元，性价比需结合当前版本强度评估。活动期间可通过每日任务积累心愿宝石，非付费玩家也能通过持续参与获取永久忍者，但需严格规划资源使用优先级。
长期规划中，组织祈愿是稳定获取碎片的重要渠道。VIP等级影响每周碎片捐赠上限，高VIP玩家可通过组织内互助快速合成忍者。S级忍者许愿需先拥有一定基础碎片，建议优先选择神卡、小南等高招A忍作为目标。加入活跃组织能提高碎片流通效率，但需注意每周一19点重置祈愿绘马和捐赠次数的机制，避免资源浪费。忍者培养应与决斗场、副本需求结合，例如阿斯玛、蝎等角色在特定场景中表现突出，可针对性补充碎片。
部分忍者如阿飞依赖空中技能和炸弹布置，对走位和时机判断要求较高；而角都等地怨虞系忍者则需掌握防反机制。实战前可通过体验卡测试连招手感，确认是否契合个人操作风格。秘卷搭配也需同步优化，如扦插之术能强化阿飞的炸弹连招，阴愈伤灭则适合反打型忍者。忍者克制关系同样不可忽视，例如空中系角色易被迪达拉、宇智波鼬等克制，需根据主流阵容调整选择策略。
